Aðgengi og upplýsingar
Líffræðileg fjölbreytni svæðisins er mikil og er þar að finna fjölskrúðugt fuglalíf sem byggist m.a. á fjölbreyttu fæðuframboði, miklum fjörum og takmörkuðu aðgengi rándýra að svæðinu.
Í Flatey hefur um langt skeið verið náið samspil manns og náttúru þar sem nýting náttúruauðlinda hefur farið fram með sjálfbærni að leiðarljósi.
Á sumrin er Flatey vinsæll viðkomustaður ferðamanna og þá sérstaklega áhugafólks um fugla og náttúru.
Friðlandið er lokað á varptíma fugla og er öll umferð um það óheimil á tímabilinu 15. apríl - 15. júlí.
Friðlýsing
Austurhluti Flateyjar var friðlýstur árið 1975 vegna fuglaverndar. Friðlandið nær yfir austurhluta eyjarinnar ásamt eyjum og hólmum sunnan við Flatey.
Verndargildi svæðisins felst fyrst og fremst í að svæðið er búsvæði og varpsvæði mikilvægra fuglastofna. Þar verpa fuglategundir sem eru sjaldgæfar á landsvísu, á válista og ábyrgðartegundir Íslendinga og til dæmis má þar nefna þórshana, kríu, teistu, lunda og toppskarf. Auk þess er þar mikið æðarvarp. Auk varpfugla hafa margar tegundir viðkomu í Flatey vor og haust, til dæmis margæs og rauðbrystingur
Vísindalegt gildi svæðisins er hátt og er fuglalíf vaktað og rannsakað þar reglulega. Meginmarkmið friðlýsingarinnar er að vernda lífríki Flateyjar, einkum varp- og búsvæði fugla, tryggja áframhaldandi rannsóknir og vöktun á lífríki eyjunnar ásamt því að fræða gesti um friðlandið og náttúru þess.